1．過濾法  空氣過濾器過濾的對象是生物粒子，不是單體微生物，因此過濾除菌是十分有效的手段。細菌單體的大小約在o．5—5叩，病毒約在o．o03—o．5沖．它們不是以單體存在，可近似把其看成1—5咧的微粒，潔凈實驗室且大多數附著在空氣中的塵粒上，實驗證明高放過濾器對生物微粒的過濾效率高于對非生物微粒的過濾效率。例如超細玻璃纖維紙高效過濾器，用DoP法測定，其穿透率為o．01％，而細菌(t．o則)的穿透率為o．枷1％，
對病毒(o．舊叩)的穿透率為o．o036％。因此通過高效空氣過濾器的空氣基本上是無菌的。同時，被捕集下來的細菌缺乏生存條件，也無法存活o
    2．物理清毒法  包括加熱消毒法和紫外線照射法等。凈化工程加熱空氣至別—枷霓，細菌會死亡，但運行費用過高潔凈實驗室，因而加熱消毒法應用很少。紫外線具有殺菌的能力，常把紫外線燈泡放在待消毒的房間內，無人時直接進行照射殺菌。照射的強度和時間，根據空氣的污染程度和細菌類別而定。潔凈室由于直接照射紫外線室內不能有人，因此對病房(尤其是重病房)、換藥室、生物實驗室的無菌操作室、門診大廳等處用紫外線直接照射很不方便。這時
可采用屏蔽式循環風紫外線消毒器，可以有效屏蔽紫外線，室內人員不需迥避和防護。此消毒器有落地式或吊掛式等型式，利用風機將室內空氣抽吸進入無奧氧紫外燈組成的輻射區殺菌后又送入室內，循環往復，潔凈室使室內細菌濃度維持在很低的水平。
    3．化學消毒  即利用殺菌劑直接在室內或送風管道中噴射滅菌潔凈實驗室，有刺激性氣味，對人體健康不利。潔凈室此外對管道及建筑材料有所損傷，對金屬和密封墊等引起腐蝕和老化。殺菌劑的滅菌效果好，常用的殺菌刑有氧化乙烯、甲醛等。